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SNP 基因型檢測- 玉米56K 芯片檢測


Axiom? Maize56K SNP Array由中玉金標記(北京)生物技術股份有限公司針對國內育種研發,由Affymetrix芯片公司采用獨特光蝕刻原位合成技術合成。

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技術特點


1.可檢測56000個SNP位點;

2.標記檢出率在97%以上;

3.基因組內標記分布均勻;

4.標記多態性好、提供標記信息豐富;

5.標記物理位置明確;

6.芯片是384制式芯片,一次實驗可檢測384個樣品的標記信息,可實現高通量檢測;

7.樣品準備的操作可在Backman自動工作站上完成;雜交,洗滌,掃描等步驟可在GeneTitan上完成,實現全自動一體化工作。


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技術流程


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項目周期


由于芯片是384制式的,需要滿384樣品才能起始實驗,中玉金標記從收到樣本到完成客戶所需的分析需要一個月左右,如果客戶需要定制化服務則可能需要更長的時間。


參考文獻


1. Martin W. Ganal et al.(2011)A Large Maize (Zea mays L.) SNP Genotyping Array: Development and Germplasm Genotyping, and Genetic Mapping to Compare with the B73 Reference Genome. Plos One 6(12):e28334

2. Zhimin L et al. (2016) Association mapping resolving the major loci Scmv2 conferring resistance to sugarcane mosaic virus in maize. Eur J Plant Pathol 

3. Gengshen C et al. (2016) Mapping of QTL conferring resistance to northern corn leaf blight using high-density SNPs in maize. Mol Breeding 36:4

4. Yong fu Tao et al. (2013) Identification and fine-mapping of a QTL, qMrdd1, that confers recessive resistance to maize rough dwarf disease. BMC Plant Biology

5. The phylogenetic relationships of US maize germplasm. CORRESPONDENCE


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